Mam pytanie czy da się w blenderze pokolorować tylko 1 część na inny kolor? np żeby w broni magazynek był niebieski a reszta szara (oczywiscie to przykład xD)czy trzeba zrobić oba obiekty oddzielnie?

Można.

sposób 1: unwrapujesz i robisz teksturę dwókolorową

sposób 2: robisz multi material.

http://wiki.blender.org/index.php/Doc:Manual/Materials/Multiple_Materials

A warto robić ten multi material? czy potem będzie trudno coś poprawić itp.?

to zależy, jeśli chodzi tylko o zmianę koloru, a materiał ten sam, to moim zdaniem nie warto, ale jeśli to mają być dwa różne materiały, powiedzmy lufa z metalu a cyngiel z drewna, to warto, ponieważ możesz im niezależnie ustawić shader. Z poprawianiem nie ma problemów, jedyne co to trzeba między nimi przełączać.

Można oczywiście też rozłączyć model na dwa, ale wtedy trzeba uważać przy przesuwaniu modelu żeby nie zapomnieć żadnego elementu.