Ostatnio używam tego systemu layerów do pomalowania modelu gameartowego.

 

Mam tych layerów sporo. Mógłbym je potem osobno poskładać w photoshopie, ale może da się je jakoś wyrenderować jako jedną mapę?

bake powinien załatwić sprawe, http://wiki.blender.org/index.php/Doc:2.6/Manual/Render/Bake#Render_Baking

Czy można w jakiś sposób wpłynąć na to w jakiej rozdzielczości tworzy się nowo dodany layer? Mi się tworzy w 2046. Jak po utworzeniu chciałem zmienić rozdzielczość to obiekt robił mi się czarny.

Jak już zapiszesz plik na dysku to zniknie opcja zmiany wielkości pliku. Zawsze możesz użyć edit externally i w np gimpie zmienić rozdzielczość.